El MININTER encarga la Prefectura Regional a la subprefecta de la provincia General Sánchez Cerro, pero con algunas restricciones. Mediante Memorándum Nro. 0000865 de fecha 13 de agosto del 2021 emitido por la directora de la Dirección de Autoridades Políticas del Ministerio del Interior (MININTER) Leslie Katherine Domínguez Zeballos, dispone que la subprefecta de la provincia General Sánchez Cerro, Gladys Bernardina Chire Bernedo, se haga cargo de tramitar los documentos de la Prefectura Regional de Moquegua.
Según el documento, no está facultada para representar a la Prefectura Regional ante actos administrativos, solo podrá verificar la gestión documentaria, así como el ingreso y egreso, tanto físico como virtual de los documentos, asimismo, implementar, atender y gestionar el libro de reclamaciones.